Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TROQ12816 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TROQ12816 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TROQ12816 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TROQ12816 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TROQ12816 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TROQ12816 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TROQ12816 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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