Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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