Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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FOXO1Q12778 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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