Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALNT1Q10472 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALNT1Q10472 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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