Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDR1Q08345 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms