Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXM1Q08050 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXM1Q08050 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms