Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP7AQ04656 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP7AQ04656 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms