Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN1Q04323 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms