Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms