Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XPCQ01831 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XPCQ01831 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XPCQ01831 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XPCQ01831 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms