Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN7AQ01118 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms