Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms