Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TFAMQ00059 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms