Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRPXP78539 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRPXP78539 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRPXP78539 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRPXP78539 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRPXP78539 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms