Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAE1P78406 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAE1P78406 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAE1P78406 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms