Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF6P62330 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARF6P62330 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms