Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCS1P62166 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCS1P62166 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms