Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RND3P61587 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RND3P61587 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RND3P61587 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RND3P61587 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RND3P61587 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RND3P61587 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms