Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms