Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVFRD-1P60508 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms