Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTBP2P56545 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTBP2P56545 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms