Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms