Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KPNA1P52294 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KPNA1P52294 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms