Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGDP52209 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PGDP52209 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms