Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TGM4P49221 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms