Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME1P48163 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ME1P48163 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ME1P48163 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ME1P48163 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms