Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC6A9P48067 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms