Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms