Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTGIRP43119 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms