Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A2P43004 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms