Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms