Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms