Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN4AP35499 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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