Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC9P31274 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC9P31274 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms