Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms