Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms