Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB2P29033 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms