Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PLNP26678 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PLNP26678 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PLNP26678 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms