Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA3P26006 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms