Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO1P25800 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO1P25800 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO1P25800 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms