Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YY1P25490 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YY1P25490 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YY1P25490 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YY1P25490 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms