Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms