Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms