Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms