Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREB1P16220 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREB1P16220 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB1P16220 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms