Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME1P15531 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME1P15531 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME1P15531 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME1P15531 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms