Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRA1P14867 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms