Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLBP1P12271 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms