Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms