Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLI4P10075 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLI4P10075 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GLI4P10075 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms